二 零 零 五 年 四 月 一 日 ， 環 境 保 護 署 與 環 境 運 輸 及 工 務 局 環 境 科 合 併 ， 使 政 策 的 制 定 和 執 行 集 中 由 同 一 部 門 負 責 ， 從 而 簡 化 決 策 程 序 。 新 的 環 保 署 負 責 制 定 包 括 自 然 保 育 的 整 體 環 境 政 策 ， 但 該 署 仍 歸 環 境 運 輸 及 工 務 局 管 轄 。 環 保 署 負 責 執 行 環 保 政 策 ， 審 核 環 境 規 劃 和 評 估 結 果 ， 執 行 和 檢 討 環 保 法 例 ， 籌 劃 和 發 展 污 水 和 固 體 廢 物 處 置 設 施 ， 推 廣 環 境 管 理 、 審 核 和 報 告 制 度 ， 並 致 力 提 高 市 民 的 環 保 意 識 。

除 了 得 到 政 府 多 個 部 門 提 供 專 業 協 助 外 ， 環 保 署 又 聽 取 環 境 諮 詢 委 員 會 的 意 見 。 委 員 會 有 15 名 成 員 ， 全 部 由 行 政 長 官 委 任 ， 包 括 來 自 民 間 環 保 組 織 和 商 界 的 成 員 ， 也 有 學 者 和 專 業 人 士 。

漁 農 自 然 護 理 署 是 負 責 生 態 環 境 及 野 生 生 物 保 育 工 作 的 主 要 部 門 。 該 署 負 責 管 理 行 政 長 官 會 同 行 政 會 議 指 定 的 郊 野 公 園 、 特 別 地 區 、 海 岸 公 園 和 海 岸 保 護 區 。 該 署 也 劃 定 和 保 護 具 重 要 生 態 價 值 的 地 區 ， 執 行 保 護 野 生 動 植 物 的 法 例 ， 審 議 環 境 影 響 評 估 報 告 及 規 劃 研 究 作 出 的 生 態 環 境 評 估 ， 並 致 力 提 高 市 民 的 自 然 保 育 意 識 。

規 劃 署 規 劃 未 來 的 土 地 用 途 ( 包 括 自 然 保 育 地 帶 )， 並 管 制 全 港 的 土 地 發 展 。 渠 務 署 設 計 、 建 造 、 操 作 和 維 修 污 水 收 集 系 統 和 污 水 處 理 設 施 。 土 木 工 程 拓 展 署 提 供 公 眾 填 土 區 ， 使 惰 性 拆 建 物 料 得 以 循 環 再 用 。 機 電 工 程 署 促 進 能 源 效 益 和 鼓 勵 市 民 節 約 能 源 。 海 事 處 清 除 海 上 的 漂 浮 垃 圾 及 油 污 ， 並 執 行 與 油 污 有 關 的 法 例 。

二 零 零 五 至 零 六 年 度 ， 政 府 在 環 境 方 面 的 支 出 預 計 合 共 54.9 億 元 ， 佔 整 體 公 共 開 支 約 2.04%。